Bio-informatique et biostatistiques
Nous utilisons des logiciels certifiés et des méthodologies avancées pour analyser et interpréter des données multi-omiques d'une manière rapide et précise.
EXPLOREZ NOS SERVICES
Analyse de données omiques
Nous employons des outils de pointe pour traiter et interpréter les données de génomique, de transcriptomique, de protéomique et de métabolomique.
Nos solutions bio-informatiques couvrent
- L’analyse des séquences
- L’analyse de l’expression des gènes
- L’analyse des pathways
- L’analyse des variantes
- L’annotation et la visualisation des données.
Nos analyses primaires et secondaires automatisées traitent des tâches telles que le contrôle de la qualité et l’alignement des reads, tandis que notre analyse tertiaire personnalisée permet une analyse plus approfondie de vos données, fournissant des informations adaptées à vos questions et objectifs de recherche.
Collaborez avec nous pour élaborer des pipelines d’analyse personnalisés afin de mieux comprendre vos données omiques, vous accordant ainsi plus de temps pour des analyses approfondies.
Génomique
Séquençage du génome entier (WGS) / Séquençage de l’exome entier (WES)
- Détection de polymorphismes nucléotidiques simples (SNP) somatiques et germinaux et d’INDELs de bases
- Analyse des fusions de gènes
- Études d’association à l’échelle du génome (GWAS) sur de grandes cohortes
Epigénomique
Méthylome
- Identification des sites de méthylation
- Détection des bases de cytosine différentiellement méthylées
- Identification des régions de liaison aux protéines
Transcriptomique
Analyse d’ARN, résultats par RT-qPCR
- Analyse des ARN non codants – panels de lncRNA – et des ARNm codants
- Analyse des pathways/termes de l’ontologie du gène (GO)
- Analyse de l’expression génétique différentielle
- Identification de nouveaux transcrits
scRNA-seq
Sur la plateforme Chromium iX de 10X Genomics
- Caractérisation des sous-types et de l’abondance des cellules
- Caractérisation des types de cellules peu courants
- Identification de biomarqueurs cellulaires
Omique spatiale
Analyse des données d’imagerie et de transcriptomique sur le logiciel MERSCOPE Vizualizer de Vizgen®.
- Clustering et détection de types cellulaires
- Découverte de biomarqueurs ARN
- Détermination de la localisation spatiale des types de cellules
Analyse de premier niveau
- Assurance de la qualité/contrôle de la qualité des données brutes (QA/QC)
- Alignement/pseudo-alignement sur la référence choisie
- QA/QC après l’alignement
- Génération de matrices de comptages bruts et normalisés
Analyse personnalisée
Suivant les enjeux biologiques ou cliniques.
- Soutien à la conception expérimentale, en accord avec les enjeux biologiques.
- Développement de logiciels personnalisés et de pipelines (R, python, NextFlow)
- Conseil sur divers projets de R&D en omique
Calcul Haute Performance (CHP/HPC)
Notre système HPC permet de traiter et d'analyser rapidement et efficacement des ensembles de données omiques à grande échelle, en utilisant des ressources informatiques de pointe pour les projets bioinformatiques les plus complexes.
Pourquoi opter pour nos services de bio-informatique ?
Résultats de haute qualité
Nous respectons des procédures strictes de contrôles de qualité afin de garantir la précision et la fiabilité de nos analyses.
Une équipe compétente
Notre équipe de bio-informatique dispose d’une solide expérience dans l’analyse précise et fiable d’un large éventail de données omiques.
Confidentialité garantie
Nous prenons toutes les mesures nécessaires pour garantir la sécurité et la protection de vos données.
Des solutions adaptées
Nous adaptons nos services aux besoins uniques de chaque projet, en collaborant étroitement avec vous pour nous assurer que notre analyse correspond à vos objectifs de recherche.
