Exploitation des données
Nos services de bio-informatique et de biostatistiques
Nous fournissons des services de bio-informatique et de biostatistiques pour tous les types de données multi-omiques, telles que RNA-seq, scRNA-seq, DNA-seq, et plus encore.
Grâce à notre expertise en calcul haute performance, nous pouvons vous aider à analyser et à interpréter vos données omiques rapidement et avec précision.
Notre contribution à votre réussite
Analyse bio-informatique
Nos services de bio-informatique comprennent l’analyse de diverses données –omiques, y compris la génomique, la transcriptomique, la protéomique et la métabolomique.
Nous utilisons des outils et des techniques de pointe pour traiter et analyser des ensembles de données vastes et complexes, afin de vous aider à comprendre les mécanismes biologiques sous-jacents à vos données.
Nos services bioinformatiques comprennent :
- Analyse de séquences
- Analyse de l’expression génétique
- Analyse du Pathway
- Analyse des variants
- Annotation
- Visualisation des données
Nous proposons des analyses primaires et secondaires automatisées pour traiter rapidement et précisément vos données omiques.
Nos pipelines automatisés peuvent prendre en charge des tâches telles que le contrôle de la qualité, l’alignement des lectures et la quantification de l’expression génique, ce qui vous permet de consacrer plus de temps à des analyses plus approfondies.
Nous proposons également des analyses tertiaires sur mesure vous permettant de mieux cerner vos données omiques.
Notre équipe collaborera avec vous pour développer des pipelines d’analyse adaptés à vos questions et objectifs de recherche spécifiques.
Détails sur les services
Génomique : Séquençage du génome entier (WGS)/Séquençage de l’exome entier (WES)
- Détection des polymorphismes nucléaires simples (SNP) somatiques et germinaux et des insertions/délétions de bases (Indels)
- Analyse des fusions de gènes
- Études d’association à l’échelle du génome (GWAS) sur de grandes cohortes
Épigénomique : Méthylome
- Identification des sites de méthylation
- Détection des bases de cytosine différentiellement méthylées
- Identification des régions de liaison aux protéines
Transcriptomique : Analyse de l’ARN, résultats de la RT-qPCR
- Analyse des ARN non codants : panels de lncRNA (kits propriétaires NeuroLINCs et Fimics) ou de miRNA (kit HTG EdgeSeq WTA), et d’ARNm codants (kit propriétaire BIOPRED)
- Analyse des voies/termes de l’ontologie du gène (GO)
- Analyse de l’expression génétique différentielle
- Identification de nouveaux transcrits
scRNA-seq : de la plateforme 10X Genomics
- Caractérisation des sous-types et de l’abondance des cellules
- Caractérisation des types de cellules peu communs
- Identification de biomarqueurs cellulaires
Transcriptomique spatiale : Analyse des données d’imagerie et de transcriptomique sur le logiciel MERSCOPE Vizualizer
- Clustering et détection de types cellulaires
- Découverte de biomarqueurs ARN
- Localisation spatiale des types de cellules
Analyse de premier niveau des données omiques :
- Données brutes Assurance de la qualité/contrôle de la qualité (AQ/CQ)
- Alignement/pseudo-alignement sur la référence choisie
QA/QC après l’alignement - Génération de matrices de comptages bruts et normalisés
Analyse personnalisée des données omiques en fonction de questions biologiques ou cliniques
- Soutien à la conception expérimentale, en accord avec les questions biologiques
- Développement de logiciels personnalisés et de pipelines (R, python, NextFlow)
- Consultation sur divers projets R&D Omics
Calcul Haute Performance (CHP/HPC)
Notre infrastructure calcul haute performance fournit la puissance de calcul nécessaire à l’analyse d’ensembles de données omiques à grande échelle, ce qui nous permet de traiter et d’analyser vos données de manière rapide et efficace.
Grâce à nos ressources informatiques de pointe, nous sommes en mesure de traiter les projets bio-informatiques les plus complexes.
Pourquoi opter pour nos services de bio-informatique et de biostatistiques ?
Performances de haute qualité
Nous respectons des procédures strictes de contrôles de qualité afin de garantir la précision et la fiabilité de nos analyses.
Une équipe compétente
Notre équipe d’experts en bioinformatique dispose d’une solide expérience dans l’analyse d’un large éventail de données omiques.
Confidentialité
Nous prenons toutes les mesures nécessaires pour garantir la sécurité et la protection de vos données.
Des solutions sur mesure
Chaque projet est unique, c’est pour cela que nous adaptons nos services pour répondre à vos besoins spécifiques.
Nous travaillons en étroite collaboration avec vous pour nous assurer que notre analyse et notre interprétation sont pertinentes par rapport à votre problématique de recherche.
Notre équipe possède l’expertise et le savoir-faire nécessaires pour vous aider à donner un sens à vos données omiques.
Nous pouvons vous fournir les outils et les ressources dont vous avez besoin pour atteindre vos objectifs de recherche.
Contactez-nous dès maintenant pour en savoir plus sur la contribution que nous pouvons apporter à vos projets bioinformatiques.
